গত ১৯ জুন স্থানীয় সময় দুপুর ১টার দিকে পর্তুগালের রাজধানী লিসবনের আলকান্তায় ইলেকট্রিক বাইসাইকেলের ব্রেকের তার ছিঁড়ে গেলে সেটি নিয়ন্ত্রণ হারায়। পরে দেয়ালে গিয়ে ধাক্কা লাগে বাই সাইকেলটির। এতে গুরুতর আহত হন মিজান। পরবর্তীতে হাসপাতালে ভর্তি থাকা অবস্থায় কোমায় চলে যান মিজান। টানা ১৭ দিন কোমায় থাকার পর গত ৫ জুলাই সকাল ১০টায় তার মৃত্যু হয়।

দেশে মিজানুর রহমানের বাড়ি সিলেটের মোগলাবাজার থানায়। তার লাশ দেশে পাঠানোর বিষয়ে সহযোগিতা করে পর্তুগাল-বাংলাদেশ কমিউনিটির নেতৃবৃন্দ ও বাংলাদেশ দূতাবাস। তাদের প্রতি কৃতজ্ঞতা প্রকাশ করে মিজানের পরিবার।